Nicolaev este unul dintre judecătorii care a făcut parte din completul ce l-a achitat în dosarul 7 aprilie pe fostul ministru de Interne Gheorghe Papuc şi pe fostul comisar al capitalei Vladimir Botnari. El a participat şi la luarea mai multor decizii care au dus ulterior la condamnarea Republicii Moldova la CEDO. 

Demisia lui Ghenadie Nicolaev a fost acceptată mai întâi de Consiliul Superior al Magistraturii care a notat în decizia sa că„în procesul de exercitare a atribuţiilor de înfăptuire a justiţiei, cât şi în afara relaţiilor de serviciu, judecătorul nu a comis fapte care să afecteze prestigiul justiţiei sau să compromită onoarea şi demnitatea funcţiei de judecător”.

CSM a anunţat, totodată, concurs pentru suplinirea funcţiei de judecător al Curţii Supreme de Justiţie.